Ignacijanske duhovne vaje potekajo v tišini. Običajno trajajo štiri do osem dni. Udeleženec duhovnih vaj se redno (enkrat ali večkrat dnevno) sreča z voditeljem.
Na ta način je omogočena zares osebna pot. Saj za to gre: za konkretno pot konkretne osebe. Udeleženec dobi nekaj navodil, smernic, v katero smer moliti, s katerimi odlomki, katero milost prositi. Nato ima čas zase, za molitev.
Pozneje v pogovoru voditelju pove, kaj se je v molitvi dogajalo, kaj je notranje občutil, kaj je Božja beseda v njem sprožala. Vse poteka v tišini. Vsakdo ima svoj čas, ritem, mir. Mnogim je danes težko vzdržati v tišini; je pa tišina zares očiščujoča. Pri osebah s kakšno psihično motnjo je treba biti pazljiv, saj je tišina lahko prenaporna. Zanje pa ima Gospod gotovo drugo možnost razodeti se, razodeti svojo voljo.